در بهار ۱۹۹۸ در شهر یومی‌یاما، کوایچی ساکاکی‌بارا قرار است کلاس‌هایش را در مدرسه‌ای جدید آغاز کند. اما به‌خاطر خوابیدن ریه در بیمارستان بستری می‌شود. وقتی در بیمارستان پرسه می‌زند، با دختری مو‌تیره به نام میی میساکی که یونیفرم مدرسهٔ جدید او را به تن دارد روبه‌رو می‌شود—برخوردی ظاهراً ساده که پیامدهایش بسیار فراتر از تصور اوست.

وقتی ساکاکی‌بارا بالاخره می‌تواند به کلاس‌های مدرسهٔ راهنمایی «یومی‌یامای شمالی» برود، متوجه می‌شود همکلاسی‌هایش با میساکی طوری رفتار می‌کنند که انگار وجود ندارد. او می‌کوشد راز پیرامون او را کشف کند، اما رفتار همکلاسی‌ها فقط عجیب‌تر می‌شود. و وقتی دانش‌آموزان کلاس ۳-۳ به‌طرزی غیرقابل توضیح یکی پس از دیگری به شکلی هولناک می‌میرند، ساکاکی‌بارا به ارتباطی میان میساکی و افزایش شمار قربانیان مشکوک می‌شود.

توانایان ذهنی شهر آکادمی در شش سطح دسته‌بندی می‌شوند؛ سطح ۰ بدون هیچ قدرتی و سطح ۵ با نیرویی سرشکن‌کننده. از میان چندین میلیون توانای ذهنی ساکن شهر آکادمی، تنها هفت نفر به سطح ۵ رسیده‌اند که قدرتمندترینشان اکسلریتور نام دارد. داستان «Toaru Kagaku no Accelerator» حول قدرتمندترین توانای ذهنی می‌چرخد که پس از فداکاری برای محافظت از لاست اُردر به قیمت از دست دادن بخش عمده‌ای از قدرتش، در بیمارستان دوران بهبودی را می‌گذراند. او زندگی نسبتاً آرامی را تجربه می‌کند تا اینکه با نجات جان اِستِل روکسن‌تال، دختری مرموز که عکسی از لاست اُردر به همراه دارد، خود را درگیر ماجرایی تازه می‌بیند. متأسفانه، اکنون اکسلریتور در برابر سازمان شومی به نام «عملیات انضباطی» قرار گرفته که می‌خواهد لاست اُردر را برای مأموریتی خطرناک به کار گیرد. حال که آنها نقشه‌شان را به اجرا گذاشته و در تعقیب دختر هستند، قدرتمندترین توانای ذهنی جهان و همراه تازه‌اش باید از لاست اُردر محافظت کنند و شهر آکادمی را امن نگه دارند.

تایکی اینوماتا، دانش‌آموز سال سوم راهنمایی، در آکادمی ایمی تحصیل می‌کند؛ مدرسه‌ای یکپارچه با برنامه‌ای قوی در زمینه ورزش. او به تیم بدمینتون دبیرستان پیوسته و تلاش می‌کند تا هرچه زودتر در تمرینات آزاد شرکت کند. اما هر چقدر هم زود برسد، همیشه دومین نفری است که وارد سالن ورزشی می‌شود. نفر اول همیشه چیناتسو کانو است؛ دانش‌آموز سال اول دبیرستان و کسی که تایکی به او علاقه دارد.

چیناتسو ستاره‌ی نوظهور تیم بسکتبال است و فاصله‌ی میان او و تایکی بسیار زیاد به نظر می‌رسد. با اینکه تایکی بازیکن خوبی در بدمینتون است، اما محبوبیت او اصلاً قابل مقایسه با چیناتسو نیست و همین موضوع باعث می‌شود احتمال اینکه احساساتش پاسخ داده شود، کمتر شود. اما در یک پیچش عجیب سرنوشت، چیناتسو به خانه‌ی تایکی نقل مکان می‌کند!

تایکی که می‌خواهد هم‌سطح و شایسته‌ی چیناتسو شود، تصمیم می‌گیرد رویای مشترکی را دنبال کند: شرکت در مسابقات کشوری. او تمریناتش را با جدیت بیشتری آغاز می‌کند، تنها برای اینکه رابطه‌ای قوی با هم‌خانه‌ای جدیدش بسازد.

وقتی به آسمان نگاه می‌کنی، چه می‌بینی؟ آسمانی آبی؟ آزادی؟ آینده‌ای امیدوارکننده؟ مردم توکیو هیچ‌یک را نمی‌بینند. در عوض، کشتی مادر تهدیدآمیز بیگانه‌ای بالای شهر سایه انداخته و چشم‌انداز آسمان را در خود فرو برده است. سه سال پیش آنها آمدند. ورود «تهاجم‌کنندگان» بزرگ‌ترین جنگ تاریخ بشر را شعله‌ور کرد؛ جنگی که تهدید به پایان دنیا بود. دولت ژاپن برای مبارزه با تهاجم‌کنندگان عجولانه سلاح‌ها را به‌صورت انبوه تولید کرد که همین موضوع به بحث‌ها و جنبش‌های صلح‌طلبانه دامن زد. آن روز، همه‌چیز تغییر کرد. با این حال، هیچ‌چیز تغییر نکرد. کادوکی کوئیاما و اوران ناکاگاوا روزهای پایانی را مانند همیشه می‌گذرانند: رفتن به مدرسه، بازی با دوستان و انجام کارهایی که هر دختر دبیرستانی بی‌خیال در زندگی‌اش دارد. اما با بزرگ‌تر شدن، درمی‌یابند معنای واقعی بزرگ‌سالی در دنیایی که بزرگ‌ترها همچون شیاطینی فریبکار و ویرانگر به نظر می‌رسند چیست. آنها می‌آموزند تهدید واقعی بشریت نه از سوی تهاجم‌کنندگان، بلکه از خود بشریت است.

برای همه‌ی مردم دنیایی که تحت سلطه‌ی جادو است، مش برندد جوان و بی‌جادو تهدیدی برای نژاد بشری محسوب می‌شود و باید حذف شود. او که مخفیانه در جنگل زندگی می‌کند، هر روز را به تمرین بدنی می‌گذراند تا عضلاتی بسازد که به اندازه‌ی جادو قدرتمند باشند!

اما زمانی که هویت واقعی‌اش فاش می‌شود و زندگی آرامش به خطر می‌افتد، مش تصمیم می‌گیرد برای تبدیل شدن به یک بینای الهی (Divine Visionary) تلاش کند؛ مقامی چنان والا که جامعه ناچار شود وجودش را بپذیرد.

به همین دلیل، برای حفظ زندگی آرام خود، مش بدون داشتن کوچک‌ترین توانایی جادویی، وارد آکادمی معتبر جادوی ایستون می‌شود؛ جایی که باید با فرزندان نخبگان و قدرتمندترین افراد سرزمین رقابت کند. او که فاقد اصلی‌ترین مهارت لازم برای زنده‌ماندن در ایستون، یعنی جادو است، از همان ابتدا در برابر هم‌کلاسی‌هایش در موضع ضعف قرار دارد.

با این حال، برای رسیدن به هدفش، مش باید با مشت‌هایش از پس هر چالشی بربیاید، جادو را با عضله شکست دهد، و همه‌ی این‌ها را تنها برای رسیدن به عنوان پرشکوه بینای الهی انجام دهد!

درون ساختمانی متروکه در کرهٔ جنوبی، تابوتی سفید آرمیده است؛ از درون آن کادیس اترامـا دی ریزل، «رای»—مردی با زیبایی باورناپذیر، وقار و نجابت—برمی‌خیزد. رای که در زمانی نامعلوم بیدار شده، باید کسی را بیابد که به او اعتماد دارد: همدم وفادارش، فرانکنشتاین. برای آغازِ تطبیق با جامعهٔ انسانی، رای لباس‌های قدیمی‌اش را به یونیفرم نو و تمیز دبیرستان «یه رَن» بدل می‌کند؛ و معلوم می‌شود مدیر همان مدرسه، خدمتکار او، فرانکنشتاین است.

پس از ۸۲۰ سال خواب، رای برای سازگار شدن با دوران کنونی به کمک فرانکنشتاین نیاز دارد؛ بنابراین فرانکنشتاین او را به‌عنوان دانش‌آموزی جدید ثبت‌نام می‌کند تا دنیای مدرن را بشناسد و زندگی عادی را تجربه کند. با این حال، نقشه‌های فرانکنشتاین خیلی زود به‌هم می‌ریزد؛ نه فقط به‌خاطر مشکلات ناشی از جامعهٔ امروز، بلکه به سبب درگیری‌های حل‌نشدهٔ گذشتهٔ پرآشوب او و اربابش. رای که چاره‌ای جز این ندارد، ناگزیر می‌شود برای حفاظت از عزیزانش از قدرت مرموز خود بهره بگیرد.

پس از آن‌که استاد «یی "شیوون" شی-وون»، یعنی «گومون‌ریونگ»، مرکز کیِ او را می‌شکند و توانایی استفاده از هنرهای رزمی‌اش را از بین می‌برد، شیوون تصمیم می‌گیرد دنیای «موریِم» را ترک کند و زندگی عادی‌اش را ادامه دهد: هر روز به مدرسه برود و نزد مادرش به خانه برگردد. اما موریِم برنامهٔ دیگری برای او دارد. وقتی مشخص می‌شود او تنها شاگرد واقعی گومون‌ریونگ است و «بانوی سوسول» مدالیون ققنوسِ قبیلهٔ سونوو را به او می‌سپارد—و عملاً او را رهبر موقت این قبیله می‌کند—جهان موریِم به این راحتی حاضر نیست شیوون را رها کند.

با این جایگاه تازه، دشمنانی که شیوون هرگز با آن‌ها روبه‌رو نشده بود یکی پس از دیگری ظاهر می‌شوند؛ از جمله سازمانی به نام «سولجرز آندر کامند». آن‌ها برای پیشرفت خود قصد حذف او را دارند. اما شیوون بدون مرکز کیِ سالم، چگونه می‌تواند از خود دفاع کند؟

هاجه کانگ دیگر طاقت ندارد. زیر فشار آزار و اذیتِ relentless، تا لبه‌ی بام مدرسه پیش می‌رود تا به همه‌چیز پایان دهد. اما درست لحظه‌ای که می‌خواهد بپرد، دانش‌آموز سال‌بالایی مرموزی به نام سی-اون لی او را (واقعاً) هُل می‌دهد—و هاجه فردای آن روز بی‌هیچ آسیبی بیدار می‌شود. هاجه خبر ندارد که سی-اون یکی از قدرتمندترین رزمی‌کاران «موریِم»، دنیای پنهان هنرهای رزمی، است. هاجه از او التماس می‌کند که آموزشَش دهد، اما هرگز تصور نمی‌کرد دنیای زیرزمینی هنرهای رزمی تا این حد پرآشوب و خطرناک باشد…

زندگی روزمره‌ی یی «شیوون» شی-وون در دبیرستان «نه اژدها» هیچ شباهتی به ایده‌آل ندارد؛ هر روز کتک خوردن از همکلاسی‌اش، هو چانگ، و دارودسته‌اش. اما یک روز، مرد مرموزی به نام هان چون وو یکی از این کتک‌زدن‌ها را می‌بیند و به جای کمک، شیوون را به خاطر نجنگیدن بزدل می‌نامد و نمک روی زخم می‌پاشد. شیوون با تعجب می‌فهمد که همین مرد، معلم جانشین زبان انگلیسیِ جدید مدرسه است.

خسته از این آزار و اذیت‌های روزانه، شیوون تصمیم می‌گیرد در یک آکادمی هنرهای رزمی ثبت‌نام کند تا از خودش دفاع کند. در راه، به طور اتفاقی هان چون وو را می‌بیند که گوشه‌ی کوچه‌ای توسط چند مرد خشمگین محاصره شده است! برانگیخته، چون وو با تکنیک‌های رزمی آن‌ها را نقش زمین می‌کند و شیوون مخفیانه همه‌چیز را ضبط می‌کند. بعدتر، با همین فیلم، او را تحت فشار می‌گذارد تا فنون دفاع شخصی را به او یاد بدهد. چون وو با اکراه می‌پذیرد و شیوون خیلی زود به دنیای هنرهای رزمی—«موریِم»—پرتاب می‌شود. با این حال، شیوون ساده‌دل است و از گذشته‌ی مشکوک استادش و تاریکی‌های پنهان جامعه بی‌خبر. حالا چون وو چطور می‌تواند هم به او آموزش بدهد و هم کمک کند در این دنیای خطرناک زنده بماند؟

شیزوکو میزوتانی که به «مورچهٔ درس‌خوان» معروف است، توجه چندانی به هم‌کلاسی‌هایش ندارد و در عوض تلاش می‌کند مانند مادرش در زندگی کاری موفق باشد. اما دنیای او وقتی دگرگون می‌شود که رشوه می‌گیرد تا جزوه‌های درسی را برای هارو یوشیدا، یاغی کلاس که پس از یک دعوای خشونت‌آمیز از مدرسه اخراج شده بود، بیاورد.

با وجود برخورد خشن و تند او در ابتدا، هارو به‌سرعت قانع می‌شود که میان آن‌ها دوستی شکل گرفته و حتی عشقش را به شیزوکو اعتراف می‌کند. هر چه زمان بیشتری را با هارو می‌گذراند، شیزوکو درمی‌یابد که زیر ظاهر خشن او، روحی مهربان و صادق نهفته است.

شایعات ماوراءالطبیعه سراسر دبیرستان کامامه آکادمی را فرا گرفته‌اند؛ به‌ویژه «هفت راز» مدرسه. یکی از این رازها افسانهٔ هاناکو-سان است؛ روح دختری جوان که در دستشویی دخترانه طبقهٔ سوم ساختمان قدیمی مدرسه سکونت دارد و گفته می‌شود هر آرزویی را که احضارش‌کننده‌اش بخواهد برآورده می‌کند. ننۀ یاشیرو، دانش‌آموز سال اول دبیرستان که شدیداً به محبت نیاز دارد، با شجاعت هاناکو-سان را احضار می‌کند، اما هاناکویی که جلویش ظاهر می‌شود پسری است!

هاناکو-کون ادعا می‌کند هیچ شیء جادویی قابل‌استفاده‌ای در اختیار ندارد؛ ننه هم با روش‌های مختلف سعی می‌کند توجه معشوقه‌اش را جلب کند. وقتی ناامیدی‌اش به اوج می‌رسد، با خوردن فلس یک پری دریایی دچار مشکل می‌شود و به ماهی تبدیل می‌گردد. هاناکو-کون او را نجات می‌دهد و سرنوشتشان را به هم پیوند می‌زند؛ در مقابل این کمک، ننه باید دستیار او شود. حال که در دنیای فراطبیعی گرفتار آمده است، ننه به زودی درمی‌یابد که رازهای هفت‌گانهٔ مدرسه بیش از شایعات سطحی هستند.

گرچه کیوکو هوری در مدرسه به‌خاطر خوش‌مشربی و استعداد تحصیلی‌اش مورد تحسین قرار می‌گیرد، جنبهٔ دیگری از زندگی‌اش را پنهان کرده است. والدینش به‌علت مشغلهٔ کاری اغلب در خانه نیستند، بنابراین هوری باید از برادر کوچکش مراقبت کند و کارهای خانه را انجام دهد و فرصتی برای معاشرت خارج از مدرسه ندارد.

در همین حال، ایزومی می‌یامورا به‌عنوان نوجوانی عبوس، عینکی و اوتاکو شناخته می‌شود. اما در واقع او فردی مهربان است که در درس خواندن ناتوان است. علاوه بر این، او نه پیرسینگ را پشت موهای بلندش پنهان کرده و یک تاتو روی پشت و شانهٔ چپش دارد.

به‌طور کاملاً اتفاقی، هوری و می‌یامورا بیرون از مدرسه با هم برخورد می‌کنند―هیچ‌یک آن‌گونه که دیگری انتظار دارد ظاهر نمی‌شود. این دو که به‌ظاهر متضادند، رفته‌رفته دوست می‌شوند و جنبه‌ای از شخصیت خود را که تاکنون به هیچ‌کس نشان نداده بودند با یکدیگر به اشتراک می‌گذارند.

سوت به صدا درمی‌آید. توپ بالا می‌رود. یک دریا (دریبل)، یک ست، یک اسپایک.

والیبال؛ ورزشی که در آن دو تیم رو‌به‌رو قرار می‌گیرند و با یک تور بلند و دیوار‌مانند از هم جدا شده‌اند.

«پیرِ کوچک»، با قد تنها ۱۷۰ سانتی‌متر، از پس تور غول‌آسا و دیوار بلاک‌کننده‌ها برمی‌آید. شُویو هیناتا، با چشمانی پر از تحسین، به قامت کلاغ‌مانند او خیره می‌شود. هیناتا که عزمش را جزم کرده تا همچون پیرِ کوچک به ارتفاعات بپرد، در سال آخر راهنمایی بالاخره تیمی تشکیل می‌دهد و در اولین تورنمنت والیبالش شرکت می‌کند. اما تیم او در نخستین دیدار مقابل دبیرستان قدرتمند کیتاگاوا دای‌ییچی، که تحت رهبری نابغه اما سرسخت «پادشاه زمین»، توبیو کاگِیا‌ما، قرار دارد، کاملاً شکست می‌خورد.

هیناتا برای گرفتن انتقام رسمی در رقابت‌های دبیرستانی و پیروی از راه پیرِ کوچک، وارد دبیرستان کاراسونو می‌شود—اما وقتی در سالن ورزشی را می‌گشاید، کاگِیا‌ما را به‌عنوان هم‌تیمی‌اش می‌بیند و نقشه‌هایش نقش بر آب می‌شود.

اکنون هیناتا باید جایگاه خود را در تیم پیدا کند و در کنار کاگِیا‌مای چالش‌برانگیز کار کند تا ضعف‌هایش را جبران کند و به رؤیای خود—رسیدن به قلهٔ دنیای والیبال دبیرستان—جامهٔ عمل بپوشاند.

در حالی که اکثر دختران آرزوی محبوبیت در میان پسران را دارند، فوتابا یوشیوکا دقیقاً نقطه‌ی مقابل آن را می‌خواهد. پس از آن‌که در دوره‌ی راهنمایی مورد تحسین بسیاری قرار گرفت و به همین خاطر از سوی هم‌کلاسی‌های دخترش طرد شد، تصمیم می‌گیرد دوران دبیرستان فرصت او برای بازسازی چهره‌اش باشد. بنابراین، او شروع به رفتار نامؤنث و بی‌تفاوت نسبت به پسران می‌کند تا در این مسیر بتواند «دوستانی» برای خود پیدا کند.

فوتابا نمی‌داند زندگی‌اش با بازگشت عشق اولش، کو مابوچی، پس از ناپدیدی ناگهانی او چند سال پیش در دوره‌ی راهنمایی، دستخوش تغییرات دیگری خواهد شد. با وجود غیبت طولانی‌مدت او، خاطرات شیرینی که با هم داشته‌اند هنوز در ذهن فوتابا باقی است و او آرزو دارد به آن روزها بازگردد. اما درمی‌یابد که آن پسر مهربان و ملایم گذشته کاملاً ناپدید شده و در عوض فردی سرد و بدبین جای او را گرفته است. کو اعتراف می‌کند که آن‌ وقت نیز نسبت به فوتابا احساس متقابل داشته، اما هشدار می‌دهد که دیگر هیچ‌گاه نمی‌توان به گذشته بازگشت، زیرا همه چیز، حتی خود او، تغییر کرده است.

Ao Haru Ride ماجراجویی‌های فوتابا را در جست‌وجوی عشق واقعی و دوستی دنبال می‌کند، در حالی که او تمام تلاشش را می‌کند تا به خودِ واقعی‌اش وفادار بماند.

تایکی اینوماتا دانش‌آموزی ورزش‌دوست و پرشور است که هر روز با اشتیاق تلاش می‌کند اولین نفری باشد که به سالن ورزشی مدرسه، معروف به «جعبه‌ی آبی»، می‌رسد. اما لبخند صبحگاهی‌اش خیلی زود محو می‌شود؛ چرا که بارها و بارها رقابت را به رهبر تیم بسکتبال دختران، چیناتسو کانو، می‌بازد. با وجود این، تایکی در دلش به این دختر ارشد علاقه دارد و تنها دیدن او دوباره روحیه‌اش را شعله‌ور می‌سازد.

با اراده‌ای محکم، تایکی تصمیم می‌گیرد به زودی عشقش را به چیناتسو ابراز کند. اما اعتراف به عشق کار آسانی نیست—به‌ویژه وقتی ممکن است چیناتسو خواستگارهای دیگری داشته باشد و تایکی برایش کاملاً غریبه باشد. آیا عشق جوانانه‌ی تایکی می‌تواند درون این جعبه‌ی آبی شکوفا شود؟